Pracownia Biobank Uniwersytetu Łódzkiego organizuje hackathon bioinformatyczny BioNinja Challenge 2019, którego celem będzie integracja środowiska bioinformatycznego oraz wypracowanie nowych rozwiązań problemów, dotykających współczesną bioinformatykę.
Wydarzenie odbywać się będzie w formie konkursowej na Wydziale Biologii i Ochrony Środowiska Uniwersytetu Łódzkiego w dniach 04 - 06.10.2019.
W czasie hackathonu, oprócz kodowania, planowane są prezentacje ekspertów związanych z analizą danych biologicznych, którzy przedstawią interesujące zagadnienia w tym zakresie. Chcielibyśmy, aby to wydarzenie łączyło osoby związane zarówno ze środowiskiem akademickim, jak i biznesowym. Do udziału zapraszamy nie tylko bioinformatyków, ale także wszystkie osoby, które w swojej pracy spotykają się z problemami związanymi z przetwarzaniem danych biologicznych/medycznych, big data i data science, genetyką, medycyną i innymi dziedzinami, w których przydatne mogą być rozwiązania bioinformatyczne.
W trakcje BioNinja Challenge 2019 uczestnicy zmierzą się z zadaniami dotykającymi zagadnienia analizy danych genetycznych, pochodzących z sekwencjonowania NGS, narzędzi wspierających przetwarzanie danych w biobankach oraz genetyki wirusów i drobnoustrojów. Aby przygotować najlepsze rozwiązania, konieczne będzie posiadanie interdyscyplinarnego zespołu, który poza wiedzą z zakresu IT, pozwalającą na implementacje algorytmów AI oraz opracowywanie optymalnych metod przetwarzania danych, wykaże się także wiedzą domenową w zakresie life science. Uczestnicy wspierani będą przez osoby doświadczone w tematyce poruszanej w trakcie hakatonu, które pomagać będą w naprowadzeniu zespołów na jak najciekawsze rozwiązania.
Organizatorem wydarzenia jest Pracownia Biobank Uniwersytetu Łódzkiego, która od roku 2016 promuje Uniwersytet Łódzki, będąc członkiem dwóch europejskich prestiżowych organizacji zrzeszających jednostki biobankujące: BCNet (Biobank and Cohort Building Network) oraz ESBB (European and Middle Eastern Society for Biopreservation and Biobanking). Jednostka należy do krajowego Konsorcjum BBMRI.pl, realizującego projekt na rzecz Infrastruktury Badawczej Biobanków i Zasobów Biomolekularnych BBMRI-ERIC (Biobanking and BioMolecular resource Research Infrastructure - European Research Infrastructure Consortium), współtworząc Polską Sieć Biobanków.
Bieżące informacje na temat wydarzenia pojawiać się będą na stronie internetowej: www.bioninjachallenge.eu/ oraz na twitterze (twitter.com/BioninjaCHLG) i Facebooku (www.facebook.com/BioNinjaChallenge/)
Partnerem technologicznym wydarzenia jest InterSynergy Software House (https://www.intersynergy.pl/) i Agencja Kreatywna Onespark (https://www.onespark.pl/)
Opracowanie: redakcja